Që nga fillimi i pandemisë, testimi diagnostik ka luajtur një rol jetik në kontrollin e përhapjes së SARS-CoV-2, virusit që shkaktonCOVID 19.Testet e shpejta të antigjenitkryera në shtëpi ose në një mjedis klinik jep rezultate në 15 minuta ose më pak.Sa më herët të diagnostikohet një person, aq më shpejt ai mund të kërkojë kujdes mjekësor dhe të izolohet nga të tjerët.Por kur shfaqen variante të reja të virusit, ato variante mund të mos zbulohen nga këto teste.
Shumica e testeve të shpejta të antigjenit janë krijuar për të zbuluar proteinën nukleokapsidike SARS-CoV-2 ose proteinën N.Kjo proteinë gjendet me bollëk në grimcat virale dhe njerëzit e infektuar.Kompleti i testimit të shpejtëZakonisht përmbajnë dy antitrupa të ndryshëm diagnostikues që lidhen me pjesë të ndryshme të proteinës N.Kur një antitrup lidhet me proteinën N në një mostër, një vijë me ngjyrë ose një sinjal tjetër shfaqet në kompletin e testit, që tregon një infeksion.
Proteina N përbëhet nga 419 njësi strukturore aminoacide.Secili prej tyre mund të zëvendësohet nga një aminoacid tjetër me mutacion.Grupi hulumtues i udhëhequr nga Ph.D.Philip Frank dhe Eric Ortlund nga Universiteti Emory nisën të hetojnë se si ky ndryshim i vetëm i aminoacideve ndikon në performancën e një testi të shpejtë të antigjenit.Ata përdorën një teknikë të quajtur skanim i thellë i mutacionit për të vlerësuar njëkohësisht se si çdo mutacion në proteinën N të virusit ndikon në lidhjen me një antitrup diagnostik.Rezultatet e tyre u publikuan në Cell më 15 shtator 2022.
Studiuesit krijuan një bibliotekë gjithëpërfshirëse me gati 8,000 mutacione të proteinave N.Këto variante përbëjnë më shumë se 99.5% të të gjitha mutacioneve të mundshme.Më pas ata vlerësuan se si secili variant ndërvepronte me 17 antitrupa të ndryshëm diagnostikues të përdorur në 11 teste të shpejta të antigjenit të disponueshëm në treg, duke përfshirëkomplete shtëpie.
Ekipi vlerësoi se cilat mutacione të proteinave N ndikojnë në njohjen e antitrupave.Bazuar në këtë informacion, ata krijuan një "profil mutacioni arratisjeje" për çdo antitrup diagnostik.Ky profil identifikon mutacione specifike në proteinën N që mund të ndikojnë në aftësinë e antitrupit për t'u lidhur me objektivin e tij.Analiza tregoi se antitrupat e përdorur në testet e shpejta të sotme njohin dhe lidhin të gjitha variantet e mëparshme dhe të tashme të SARS-CoV-2 shqetësuese dhe shqetësuese.
Megjithëse disa antitrupa diagnostikues njohin të njëjtin rajon të proteinës N, studiuesit zbuluan se çdo antitrup ka një nënshkrim unik të mutacioneve të arratisjes.Ndërsa virusi SARS-CoV-2 vazhdon të ndryshojë dhe të gjenerojë variante të reja, këto të dhëna mund të përdoren për të shënuar antitrupat e kompletit të testimit që mund të kenë nevojë të rivlerësohen.
“Identifikimi i saktë dhe efikas i individëve të infektuar mbetet një strategji kritike për zbutjen e COVID-19 dhe studimi ynë ofron informacion mbi mutacionet e ardhshme SARS-CoV-2 që mund të ndërhyjnë në zbulimin”, tha Ortlund."Rezultatet e përshkruara këtu na lejojnë të përshtatemi me shpejtësi ndaj këtij virusi ndërsa variante të reja vazhdojnë të shfaqen, duke paraqitur implikime të menjëhershme klinike dhe të shëndetit publik."
Sfondi: Skanimi i thellë i mutacionit zbulon mutacionet e arratisjes në nukleokapsidin SARS-CoV-2 duke përdorur teste të shpejta të antigjenit të disponueshëm aktualisht.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA qelizë.2022 15 shtator;185(19):3603-3616.e13.Ministria e Brendshme: 10.1016/j.cel.2022.08.010.29 gusht 2022 PMID: 36084631.
Financimi: Instituti Kombëtar për Imazhe Biomjekësore dhe Bioinxhinieri NIH (NIBIB), Instituti Kombëtar i Diabetit, Sëmundjeve Digjestive dhe Veshkave (NIDDK) dhe Instituti Kombëtar i Alergjisë dhe Sëmundjeve Infektive (NIAID), Shoqata Amerikane e Zemrës.
NIH Research Matters është një përditësim javor i gjetjeve kryesore të kërkimit të NIH të rishikuara nga ekspertët e NIH.Është publikuar nga Zyra e Komunikimit dhe Marrëdhënieve me Publikun e Drejtorit të Institutit Kombëtar të Shëndetësisë.